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國(guó)際阿里云3大高性能核算解決計(jì)劃國(guó)際版 (阿里云 騰訊云 騰訊云 華為云 聚名 注冊(cè)?實(shí)名注冊(cè)?實(shí)名等)
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去年8 月 5 日,在 2022 阿里云生命科學(xué)與智能核算峰會(huì)上,阿里云高性能核算研制負(fù)責(zé)人何萬(wàn)青發(fā)布了《生命科學(xué)職業(yè)云上解決計(jì)劃及最佳實(shí)踐》白皮書,并同步推出了高性能容器、大內(nèi)存、高 IO 等三大高性能核算解決計(jì)劃,滿意基因測(cè)序與 AI 制藥領(lǐng)域中海量級(jí)數(shù)據(jù)剖析、作業(yè)流程與環(huán)境各異等場(chǎng)景需求。
生命科學(xué)職業(yè)開展至今,早已離不開高性能核算(High Performance Computing)的輔佐,從核算機(jī)輔佐藥物規(guī)劃、疫苗研制,到經(jīng)過基因檢測(cè)供給精準(zhǔn)醫(yī)療服務(wù)、產(chǎn)前篩查等,高性能核算 HPC 在生命科學(xué)研討中扮演著十分重要的人物。
跟著云核算技能服務(wù)及實(shí)踐的日趨成熟,越來(lái)越多的職業(yè)經(jīng)過上云完成了整個(gè)產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級(jí),正處于黃金時(shí)期的生命科學(xué)職業(yè)也不例外。但是,目前針對(duì)生命科學(xué)職業(yè)的解決計(jì)劃大部分都為線下 IDC 超算集群計(jì)劃,跟著基因組學(xué)、生物制藥技能的不斷演進(jìn)及核算機(jī)科學(xué)的不斷開展,傳統(tǒng)核算機(jī)集群資源已無(wú)法滿意生命科學(xué)職業(yè)及技能演進(jìn)的需求。
本次發(fā)布的《生命科學(xué)職業(yè)云上解決計(jì)劃及最佳實(shí)踐》白皮書指出,生命科學(xué)企業(yè)的 IT 基礎(chǔ)設(shè)施主要面對(duì)資源規(guī)劃固定、建造周期長(zhǎng)和硬件資源運(yùn)維本錢高三大問題。一起生命科學(xué)職業(yè)也期望擁抱公共云架構(gòu)、運(yùn)用異構(gòu)核算與人工智能等新技能。
何萬(wàn)青表明,云上高性能核算是目前 HPC 建造運(yùn)用的最佳途徑。在原來(lái)公共云與混合云兩大解決計(jì)劃的基礎(chǔ)上,針對(duì)生命科學(xué)職業(yè)的不同需求,海外阿里云代理商 在該白皮書中新發(fā)布了高性能容器、大內(nèi)存、高 IO 等三大高性能核算解決計(jì)劃,共計(jì)五大解決計(jì)劃:
1. 公共云解決計(jì)劃:供給一套通用的公共云架構(gòu)的解決計(jì)劃,滿意用戶快速快捷運(yùn)用云上 HPC 服務(wù)的需求,并根據(jù)事務(wù)的高峰和低谷動(dòng)態(tài)進(jìn)行核算資源的彈性擴(kuò)縮容,有效節(jié)約事務(wù)本錢。計(jì)劃尤其適用于快速開展的生命科學(xué)企業(yè)。
2. 混合云架構(gòu)解決計(jì)劃:部分企業(yè)具有線下 IDC 數(shù)據(jù)中心,但基礎(chǔ)設(shè)施偏舊。跟著事務(wù)的快速增長(zhǎng),期望能夠運(yùn)用阿里云 E-HPC 供給的微弱新算力,一起利舊 IDC 數(shù)據(jù)中心資源。這種情況可用混合云架構(gòu)統(tǒng)一辦理云上云下資源,與公共云打通,支撐彈性擴(kuò)縮容。企業(yè)可按需挑選辦理節(jié)點(diǎn)設(shè)置在云上或云下。
3. HPC+AI 的高性能容器計(jì)劃:適用于藥物研制和事務(wù)流程雜亂多樣的生信事務(wù),觸及運(yùn)用版本很多、依靠環(huán)境雜亂,不同的工作流或許根據(jù)不同的操作系統(tǒng)和編譯器構(gòu)建。阿里云 E-HPC 高性能容器運(yùn)用 eStack 可讓運(yùn)用多種軟件棧的生信運(yùn)用運(yùn)行在同一個(gè)渠道,快捷辦理,支撐多種調(diào)度器和底層資源,兼容性十分高。
4. 生信職業(yè)運(yùn)用大內(nèi)存解決計(jì)劃:阿里云與合作伙伴 Memverge 聯(lián)合推出,適用于需要進(jìn)行海量數(shù)據(jù)剖析的事務(wù),如基因測(cè)序中每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)量數(shù)據(jù)高達(dá)數(shù)十萬(wàn)條讀取 (reads),這種海量級(jí)的數(shù)據(jù)剖析需要大內(nèi)存容量。運(yùn)用部署 MemVerge Memory Machine 軟件的 ECS i4p 實(shí)例作為核算節(jié)點(diǎn),可滿意事務(wù)對(duì)性能的極致要求,一起阿里云 E-HPC 可主動(dòng)納管所有節(jié)點(diǎn)。
5. 生信職業(yè)運(yùn)用高 IO 解決計(jì)劃:基因組織學(xué)研討產(chǎn)生的數(shù)據(jù)增長(zhǎng)快速且需永久保存,要求存儲(chǔ)系統(tǒng)具有海量容量及高擴(kuò)展性。另外,海外阿里云代理商 基因研討運(yùn)用軟件種類很多,部分核算任務(wù)對(duì) IO 吞吐要求很高。對(duì)此,阿里云與合作伙伴聯(lián)科集團(tuán)聯(lián)合推出生信職業(yè)運(yùn)用高 IO 解決計(jì)劃。
上述解決計(jì)劃能夠掩蓋生命科學(xué)職業(yè)的絕大多數(shù)場(chǎng)景與需求,具有掩蓋全球的豐富算力,極致性能,彈性彈性才能幫助客戶降本提效,管控可視化幫助用戶省心運(yùn)維等優(yōu)勢(shì)。目前,阿里云高性能核算廣泛運(yùn)用于工業(yè)仿真(CAD/CAE)、芯片規(guī)劃(EDA)、生物醫(yī)藥資料、能源勘探與公共服務(wù)等多個(gè)職業(yè)。
「深勢(shì)科技」運(yùn)用彈性供應(yīng)的本錢優(yōu)化戰(zhàn)略,結(jié)合搶占式實(shí)例的價(jià)格,以 30% 的本錢完成海量資源的交給。一起云上彈性高性能核算 E-HPC 主動(dòng)運(yùn)維的特性,降低了深勢(shì)科技的運(yùn)維本錢,提升了集群辦理功率。
生命醫(yī)學(xué)企業(yè)「圣庭醫(yī)療」經(jīng)過上云優(yōu)化了傳統(tǒng) IDC 集群的數(shù)據(jù)可靠性、運(yùn)維本錢及功率問題,基因比對(duì)與剖析功率提升了 70%。海外阿里云代理商 高性能核算團(tuán)隊(duì)還經(jīng)過結(jié)合 Slurm 事務(wù)工作流 dependency 與主動(dòng)彈性的結(jié)合,削減了無(wú)效的核算資源浪費(fèi),有效降低了運(yùn)用本錢。
在本次峰會(huì)上,天池大賽——“立異大師杯冷凍電鏡蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)建模大賽”頒獎(jiǎng)典禮也同期舉行,全球近 2000 名參賽者一同探索云核算與蛋白質(zhì)研討的前沿課題,大賽全程從阿里云 E-HPC 渠道、英特爾第三代至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器(Cooper Lake)、深度學(xué)習(xí)加快和增強(qiáng)型 AVX-512 指令集等軟硬件結(jié)合的角度進(jìn)行全程輔導(dǎo)和訓(xùn)練,推進(jìn)全職業(yè)對(duì)人才培養(yǎng)的繼續(xù)關(guān)注。
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